Το Αμύνταιο γνώρισε σημαντική άνθηση στις αρχές του 20^ου αιώνα, όταν λόγω του κομβικού του σημείου μετεξελίχθηκε σε διαμετακομιστικό κέντρο. Η σιδηροδρομική γραμμή Θεσσαλονίκης – Μοναστηρίου, που στο Αμύνταιο διακλαδώνεται προς Κοζάνη, ήταν αυτή που έδωσε την ώθηση στον μικρό γεωργοκτηνοτροφικό οικισμό του 19^ου αιώνα να γίνει ένα σημαντικό εμπορικό κέντρο για μισό περίπου αιώνα. Άνθρωποι και εμπορεύματα δημιούργησαν συνθήκες ανάπτυξης για το Αμύνταιο, που μεγάλωνε ραγδαία με την έλευση κατοίκων των γειτονικών οικισμών.

Η σταδιακή μείωση της εμπορικής δραστηριότητας με το Μοναστήρι (Bitola) λειτούργησε αρνητικά και για το Αμύνταιο ως διαμετακομιστικό κέντρο. Σήμερα η εμπορική κίνηση της πόλης σχετίζεται με την εξυπηρέτηση της τοπικής κοινωνίας του Αμυνταίου και της ευρύτερης περιοχής. Παρ’ όλα αυτά υπάρχει ικανός αριθμός εμπορικών καταστημάτων με ποιοτικές προδιαγραφές, λόγω της εμπορικής κουλτούρας της πόλης, και προσιτές τιμές. Τα εμπορικά καταστήματα του Αμυνταίου καλύπτουν το σύνολο των αναγκών της τοπικής κοινωνίας, καθώς υπάρχει δραστηριοποίηση σε όλους τους εμπορικούς τομείς. Επίσης, στις μεγαλύτερες Κοινότητες της περιοχής υπάρχουν εμπορικά καταστήματα που καλύπτουν τις βασικές ανάγκες των κατοίκων.